Las críticas al CNE se han basado en sostener que supuestamente viola el fuero del presidente de la República y que, además, vulneraría lo establecido por la Corte IDH: ”la falta de competencia de una autoridad administrativa para restringir los derechos políticos de funcionarios públicos democráticamente electos, mediante las sanciones de inhabilitación o destitución”.
Según la ley, "de comprobarse irregularidades en el financiamiento” el CNE solo puede establecer sanciones administrativas como, p. ej,, multas. Pero no investiga ni sanciona penalmente ni al Presidente ni a nadie. Tampoco puede suspender, destituir o inhabilitar al Presidente.
Así las cosas, las competencias del CNE no van en contra, de ninguna manera, de los establecido por la Corte IDH. De hecho, sus competencias y sanciones administrativas del CNE no son siquiera una restricción a los derechos políticos. En........